Palazzo delle Papesse è situato nel centro storico di Siena, in Via di Città, e pertanto non è consentito raggiungerlo direttamente in auto. I parcheggi più vicini sono ubicati in prossimità della cinta muraria, in particolare il parcheggio Il Campo, il parcheggio Duomo e il parcheggio Santa Caterina, collegato con scale mobili al centro città.