La baia è uno degli specchi d’acqua più trafficati e popolosi del mondo: vi si affacciano infatti il porto di Yokohama, che è il principale scalo di cabotaggio del Giappone, il porto di Tokyo, dedito alla pesca, e il porto di Chiba, che gestisce un impressionante traffico di merci tali da porlo alle spalle della sola Singapore, come secondo porto mercantile del mondo. La baia è una profonda insenatura dell’Oceano Pacifico, il cui settore occidentale è foltamente urbanizzato, giacché vi sorge la megalopoli Tokyo-Yokohama-Kawasaki. Sulle sue acque si rispecchiano inoltre due aeroporti, un’autostrada ed una ferrovia. Numerosi fiumi si riversano nella baia di Tokyo e tutti forniscono acqua alle aree residenziali e industriali lungo la baia. I fiumi Tama e Sumida si riversano nella baia di Tokyo. Il fiume Edo sfocia nella baia tra Tokyo e la prefettura di Chiba. I fiumi Obitsu e Yōrō defluiscono nella baia della prefettura di Chiba. La baia di Tokyo si protende prominente nella pianura di Kantō] È circondata dalla penisola di Bōsō nella prefettura di Chiba a est e dalla penisola di Miura nella prefettura di Kanagawa a ovest. La costa della baia di Tokyo è costituita da un altopiano diluviale ed è soggetta a rapida erosione marina. I sedimenti sulla riva della baia creano una costa liscia e continua.